Una volta che la membrana di osmosi è entrata in contatto con l'acqua dopo la produzione, deve rimanere "bagnata o in acqua" in modo permanente. Inoltre, ha bisogno di alcuni giorni o di diverse migliaia di litri di funzionamento per essere completamente "gonfia" e quindi "a posto" in termini di volume di uscita all'ora e anche di conducibilità (qualità dell'acqua). Se questa membrana dovesse seccarsi, in genere non sarebbe più utilizzabile. Per questo motivo, la maggior parte dei sistemi è progettata in modo che l'alloggiamento della membrana sia pieno d'acqua anche quando è spento o non viene utilizzato.
Quest'acqua, a sua volta, può "rovesciarsi" nel tempo o i batteri possono moltiplicarsi nell'acqua se non viene sostituita. Questa proliferazione di germi e batteri può danneggiare le membrane. Di conseguenza, i sistemi a membrana devono essere utilizzati regolarmente e l'acqua residua nelle membrane deve essere sostituita di tanto in tanto.
In genere, questa operazione viene effettuata accendendo e sciacquando brevemente le macchine.
A seconda delle specifiche del produttore e della progettazione degli impianti di osmosi, questa operazione deve essere eseguita ogni 4-12 settimane. Fondamentalmente, è anche possibile conservare le membrane con conservanti appropriati. Poiché questo processo richiede molto tempo e di solito deve essere ripetuto dopo 3 mesi, in genere lo sconsigliamo in relazione ai lavori di pulizia.